骨髓抑制和心脏毒性是多柔比星最主要的两种不良反应。
1.皮肤及皮下组织损伤：脱发是最常见的不良反应，大约86%接受多柔比星治疗的患者会出现脱发，男性患者伴有胡须生长停滞，但停止治疗后所有毛发均可恢复正常生长。局部毒性、皮疹/瘙痒、皮肤变化、皮肤及指甲过度色素沉着、光敏反应、照射皮肤过敏（放射线回忆反应）、风疹、肢体末端红斑和手足综合症。
2.早期乳腺癌患者接受含多柔比星辅助治疗的研究中，除已知多柔比星的不良反应外，还观察到患者出现体重增加。
3.感染和侵染：感染，脓毒血症/败血症。
4.良性及恶性病变：急性淋巴细胞性白血病、急性髓细胞性白血病。
5.血液和淋巴系统损伤：骨髓抑制、白细胞减少、中性粒细胞减少、贫血和血小板减少。
6.免疫系统异常：偶见过敏性症状、并伴有发热、寒战、和/或风疹。过敏性休克也有所报道。
7.代谢及营养失衡：厌食、脱水和高尿酸血症。
8.眼部异常：结膜炎/角膜炎和流泪。
9.血管异常：出血、潮热、静脉炎、血栓性静脉炎、血栓栓塞和休克。
10.生殖系统及乳腺异常：闭经、精子减少和无精。
11.全身性及给药部位异常：不适/虚弱、发热、寒颤，多柔比星给药时溢出静脉会造成组织损伤甚至坏死。小静脉注射或反复注射同一血管会造成静脉硬化。
12.骨髓抑制和口腔溃疡：存在骨髓抑制和口腔溃疡时不可重复使用本品，后者可能存在口腔烧灼感的先兆症状，出现症状时应不再使用。多柔比星使用后10天左右可出现明显的骨髓抑制，故不管是血液疾病或非血液疾病患者都应常规监测血象。
13.心脏毒性：心脏毒性可表现为窦性心动过速、心动过速、房室传导阻滞和束支传导阻滞、充血性心力衰竭，包括室上性心动过速和心电图改变。建议常规监测心电图，对已有心功能损害的患者需格外小心。累积剂量超过450-500mg/m²时须特别小心，超过该剂量水平时，发生不可逆性充血性心力衰竭的危险性大大增加。当考虑多柔比星的用药总量时，应对患者以往或同时使用其他有明显心脏毒性药物的使用情况进行综合评定，如高剂量静脉给药的环磷酰胺，纵隔放疗或相关的蒽环类化合物如柔红霉素。已证实每周给予多柔比星比每三周给予多柔比星的心脏毒性要低，这样可允许患者得到较高的累积剂量的治疗。必须注意心力衰竭可在用药后几周出现，且可能对治疗无反应。建议检测基础心电图，并在用药期间和用药后即刻做心电图随访。一过性心电图改变，如T波低平，S-T段下降和心律失常，并不认为是停止使用药物的指征。现在认为QRS波降低是心脏毒性较为特异的表现。如果出现这个变化，须慎重权衡继续用药治疗的益处及发生不可逆性心脏损害的风险两者间的关系。严重的心力衰竭可突然发生，而预先无心电图改变。
14.肾脏及泌尿系统异常：给药1-2天后可使尿液呈红色，可告知患者不必紧张。膀胱内给药可引起血尿、膀胱及尿道烧灼感、排尿困难、尿痛、尿频，这些症状均是轻微且短暂的。
15.胃肠道反应：粘膜炎/口腔炎，给药后5-10天可出现口腔炎，症状表现为剧痛，主要发生在舌侧及舌下粘膜，其发生频率及严重程度与重复给药有关，包括连续三天给予多柔比星。其他胃肠道反应还包括恶心、呕吐、口腔粘膜色素沉着、食道炎、腹痛、胃黏膜损伤、胃肠道出血、腹泻和结肠炎。
16.其他：肝肾功能异常。
17.检查：心电图异常、无症状的左心室射血分数降低和转氨酶水平改变。

通则：多柔比星必须在有使用细胞毒药物经验的医生指导下使用。
多柔比星开始治疗前，患者应已从之前的细胞毒药物治疗的急性毒性反应（如口腔炎、中性粒细胞减少、血小板减少和全身性感染）中恢复。
肥胖患者其多柔比星的全身清除率是下降的。
心脏功能：使用蒽环类药物有发生心脏毒性的风险，表现为早期（即急性）或晚期（即迟发）事件。
早期（即急性）事件：多柔比星的早期心脏毒性主要包括窦性心动过速和/或心电图（ECG）异常，如非特异性ST-T波改变。快速性心律失常，包括室性早搏和室性心动过速、心动过缓，以及房室和束支传导阻滞都有报道。这些不良事件通常对后续的迟发性心脏毒性的发生并无预示作用，很少有临床意义，而且通常无需为此停止多柔比星的治疗。
晚期（即迟发）事件：迟发性心脏毒性通常发生在多柔比星治疗过程的后期，或者发生在治疗终止后的2至3个月。但也有报道在治疗结束后数月到数年出现的迟发性事件。迟发性心肌病可表现为左心室射血分数（LVEF）降低和/或充血性心力衰竭（CHF）的症状和体征，如呼吸困难、肺水肿、坠积性水肿、心脏肥大、肝肿大、少尿、腹水、胸腔积液和奔马律。也有亚急性症状，如心包炎/心肌炎的报道。蒽环类药物引起的最严重的心肌病为危及生命的充血性心力衰竭，表现为累积性的剂量限制性毒性。
在使用多柔比星治疗前，需要进行心脏功能的评估，而且在整个治疗期间需要监测心脏功能，以尽可能地减少发生严重心脏功能损害的风险。在治疗期间定期监测左室射血分数（LVEF），一旦出现心脏功能损害的表现应立即停用多柔比星，可减小心脏毒性发生的风险。可以运用MUGA扫描（多门核素血管造影术）或者超声心动图（ECHO）对心脏功能进行反复的量化评估（对LVEF的评估）。推荐在基线的时候进行心电图、MUGA扫描或者ECHO检查，这尤其适合于那些具有高危风险因素的患者。应反复进行MUGA扫描或ECHO检查以评估左室射血分数，尤其是在使用高累积剂量蒽环类药物时。这种评估技术在随访期间也应坚持使用。随访过程中，用于监测心脏功能的检测手段应保持一致。
当累积剂量为300mg/m²时，发生CHF的概率约为1%～2%，随着累积剂量升高至450-550mg/m²，该概率会缓慢升高。此后，发生CHF的风险会迅速升高，因此建议最大累积剂量不要超过550mg/m²。
发生心脏毒性的风险因素包括活动性或非活动性心血管疾病、目前或既往接受过纵膈/心脏周围区域的放射治疗、之前用过其他蒽环类药物或者蒽二酮药物、同时使用其他抑制心肌收缩功能的药物或者具有心脏毒性的药物（例如曲妥珠单抗）。除非患者的心功能得到严密的监测，否则蒽环类药物包括多柔比星不能与其他具有心脏毒性的药物同时使用。患者在停止使用其他具有心脏毒性的药物（特别是具有长半衰期的药物例如曲妥珠单抗）之后接受蒽环类药物，也可能会增加发生心脏毒性的风险。曲妥珠单抗的半衰期约为28.5天并且在血循环中可以持续至24周。因此，如果可能，医师应该在停用曲妥珠单抗之后的24周内避免使用以蒽环类药物为基础的治疗。如果在该时间之前需要使用蒽环类药物，须密切监测心脏功能。
对接受高累积剂量多柔比星及具有高危风险的患者应进行严格的心脏功能的监测。然而，无论是否存在心脏毒性危险因素，在累积剂量较低时，仍有可能发生心脏毒性。儿童和青少年使用多柔比星后，发生迟发性心脏毒性的风险增加。女性患者发生迟发性心脏毒性的风险或许高于男性患者。推荐进行定期的心脏功能评估以监测该毒性发生的可能。
多柔比星和其它蒽环类或蒽二酮类药物的毒性作用可能是累加的。
血液学毒性：当与其它细胞毒性药物联用时，多柔比星可以导致骨髓抑制。使用多柔比星前及每个周期都应进行血液学检查，包括白细胞（WBC）计数。剂量依赖性的、可逆的白细胞减少和/或粒细胞减少（中性粒细胞减少）是多柔比星主要的血液学毒性，并且是多柔比星最常见的急性剂量限制性毒性。白细胞减少和中性粒细胞减少一般在用药后的10至14天达到最低点。大部分患者的白细胞/中性粒细胞计数会在21天内恢复至正常范围。也可能会发生血小板减少和贫血。严重骨髓抑制的临床表现包括发热、感染、脓毒血症/败血症、感染性休克、出血、组织缺氧、甚至死亡。
继发性白血病：有报导在使用蒽环类药物包括多柔比星治疗的患者中出现了继发性白血病，可伴或不伴白血病前期症状。下列情况下出现继发性白血病更为常见：当与作用机制为破坏DNA结构的抗癌药物联合使用时，或与放疗联合时，或患者既往多次使用细胞毒药物时，或者蒽环类药物治疗剂量增加时。此类白血病的潜伏期通常为1～3年。
胃肠道：多柔比星会引起呕吐反应。口腔炎/粘膜炎通常会发生在给药后的早期，如果情况严重，几天后可能会进展为粘膜溃疡。绝大多数的患者在给药后的第三周得以恢复。
急性非淋巴细胞性白血病患者连续3天使用多柔比星和阿糖胞苷联合化疗，可能发生结肠组织溃疡和坏死，并由出血或感染而导致死亡。
肝功能：多柔比星主要通过肝胆系统清除。在用药前及用药过程中需对血清总胆红素水平进行评估。伴有胆红素升高的患者可能出现药物清除减慢，全身毒性增加。这些患者需要进行减量。有严重肝功能损害的患者不能接受多柔比星的治疗。
注射部位反应：小静脉注射或者反复注射同一静脉可能造成静脉硬化，按照推荐的给药流程操作可以尽可能的减少注射部位静脉炎/血栓性静脉炎的发生。
药物外渗：多柔比星静脉注射时发生外渗会导致局部疼痛、严重组织损伤（发疱、严重的蜂窝组织炎）和坏死。注射时一旦发生药液外渗的症状和体征，应立即停止注射。
肿瘤溶解综合症：使用多柔比星可能会导致高尿酸血症，其原因是伴随药物诱导的肿瘤细胞的迅速崩解而产生过度的嘌呤分解代谢（肿瘤溶解综合征）。因此在初始治疗开始后需要监测血尿酸、钾、钙、磷和肌酐等情况。水化、碱化尿液、预防性使用别嘌呤醇以预防高尿酸血症的出现，从而尽可能的减少肿瘤溶解综合症的发生。
免疫抑制效应/感染易感性增加：对于接受化疗药物包括多柔比星而导致免疫妥协的患者接种活疫苗或者减毒活疫苗可能会产生严重甚至致命的感染。正在接受多柔比星的患者应该避免接种活疫苗。可以接种死疫苗或者灭活疫苗，但是对这些疫苗的免疫应答可能会降低。
膀胱内给药：膀胱内使用本品时要特别谨慎。多柔比星膀胱内给药可能会引起化学性膀胱炎相关症状（如排尿困难、多尿、夜尿、痛性尿淋沥、血尿、膀胱不适感、膀胱壁坏死）及膀胱痉挛。需要特别留意插管的问题（例如因膀胱内巨大肿瘤引起的尿道梗阻）。建议在给药期间及药液从膀胱排空后立即给予正确的尿道冲洗。
其他：多柔比星可以加重其他抗肿瘤药物的毒性反应。有报道称其可加重环磷酰胺导致的出血性膀胱炎和6-巯嘌呤的肝脏毒性。还有报道称其能增加放疗导致的毒性反应（如心肌、粘膜、皮肤和肝脏的损害）。
已有报道和其他细胞毒药物联合使用时，使用多柔比星的患者有发生血栓性静脉炎、血栓栓塞，包括肺栓塞的情况（其中有些是致命的）。
与大多数细胞毒类药物和免疫抑制剂一样，本品在特定试验条件下观察到对动物有一定致癌性。多柔比星在给药后1-2天可使尿液呈红色。
操作时的注意事项：瓶内药物处于负压状态，以此减少溶液配制时形成的气雾，当针头插入后应特别小心。在配制药液时应避免吸入任何气雾。
由于该药的毒性特征，推荐以下的保护方法：
-操作人员必须受过药物配制及操作的良好技术训练。
-怀孕的工作人员应避免接触本品。
-速溶型多柔比星的操作者应穿戴防护服装：护目镜、工作袍及一次性手套和面罩。
-药物配制应在指定区域进行（在层流系统下更佳）。工作台表面应铺有一次性的背面为塑料涂层的吸水纸。
-所有用于药物配制、注射或清洗的材料包括手套等，用后应置于标有“高度危险”的废弃袋内供高温焚烧。
-如不慎与皮肤或眼睛接触，应立即用肥皂和清水彻底清洗接触处皮肤，以碳酸氢钠溶液冲洗眼部。并向医生咨询。
-药液渗出或漏出，应用1%次氯酸钠溶液处理，浸泡过夜最佳，然后用水冲洗。
-所有的清洗材料均应按上法处理。
配制后的溶液于室温避光可稳定保存24小时，4～10℃下可保持稳定48小时。
配制后的溶液含有0.02%的羟基苯甲酸酯，但这不可视为含防腐剂的保存溶液。
应根据当地法规要求，弃去任何多余未用的药物及废弃物。

见【用法用量】。

多柔比星急性药物过量会导致严重的骨髓抑制（主要表现为白细胞降低和血小板降低）、胃肠道毒性反应（主要为粘膜炎）和急性心功能改变。
已证实单次使用250mg和500mg的多柔比星是致命的。这些剂量可导致24小时内急性心肌衰竭和严重的骨髓抑制，且用药后10-15天效应最大，在此期间应加强支持疗法，并采取输血、无菌隔离护理等措施。延迟性心力衰竭可于过量用药半年后出现，病人应密切观察，一旦出现心力衰竭征象时应予以常规治疗。

吸收：多柔比星不能通过胃肠道吸收。由于对组织具有强烈刺激性，故药物必须通过血管给药（静脉内或动脉内）。已证明膀胱内给药也是可行的，这一给药途径下药物很少进入体循环。
分布：多柔比星迅速而广泛地分布入周边室，初始血浆半衰期很短（5-10分钟），稳态分布容积超过20-30L/Kg，但多柔比星不能通过血-脑屏障。血浆蛋白结合率约为75%，并且血药浓度低于2μM时药物血浆蛋白结合率与血药浓度无关。
代谢：主要由肝脏代谢。主要代谢物是由醛酮还原酶作用产生的13-羟-多柔比星醇，该代谢物也有一定抗肿瘤活性。尿液和胆汁中的主要代谢物是多柔比星和13-羟-多柔比星醇。血浆中可检测到的其他代谢物还有多柔比星糖苷配基和13-羟-多柔比星醇糖苷配基。
排泄：静脉给药后，多柔比星血浆浓度呈多相衰减，终末相半衰期为20至48小时。代谢物13-羟-多柔比星醇的终末相半衰期与原形药物相似。血浆清除率为8至20ml/min/kg，主要由于代谢和胆汁排泄。在肝功能受损患者，这一较慢的血浆消除可能更慢。多柔比星的清除很大程度是药物代谢转化为一系列无活性或活性较低的产物。胆汁和粪便中七天内可排出用药量的40-50%。肾脏分泌较少，五天内只有5-10%的用药量从尿中排出。